Село Шекшово — весьма древнего происхождения. Раскопки, проведенные вблизи Малого-Давыдовского и Шекшово (на урочище «Половецкая лужа» в 1852—1855 годах) дают право предполагать, что первые селения здесь появились в X—XI веках.
В старинных документах (летописях) Шекшово в первый раз упоминается в «договорной грамоте суздальских князей Василия и Федора Юрьевичей с князем Дмитрием Юрьевичем (Шемякой) и его сыном князем Иваном о бытии им в дружбе и согласии» от 1446 года.
Из этой грамоты видно, что село существовало еще в XIV веке и было дворцовым имением суздальского князя Дмитрия Константиновича—тестя Дмитрия Донского. Василий и Федор Юрьевичи в числе прочих условий договора с Дмитрием Шемякой требовали возвращения им родового имения Шекшово, как исстари принадлежавшего суздальским князьям. Но, очевидно, они не получили села, так как в духовном завещании Великого князя московского Василия Васильевича II (Темного) от 1462 года, оно значится его вотчиной. В том же году великий князь в «духовной» грамоте завещал Шекшово супруге Марье Ярославовне. После этого село долгое время было «государевым дворцовым имением». С 1864 года в Шекшово существовала земская народная школа. В это время в селе было 135 дворов и душ мужского пола — 530, а женского — 594.
В XIV веке уже имелась деревянная церковь, а в 1795 году на ее месте был построен каменный пятиглавый храм, в 1813 году был надстроен второй этаж и возведена колокольня, обнесенная оградой. Это величественное уникальное сооружение сохранилось до настоящего времени. Шекшовские земли расположены в зоне Владимиро-Суздальского ополья и природой не обделены; красота и плодородие их издавна были примечены людьми.

